Microbiología Clínica

La asignatura Microbiología Clínica se dicta en el noveno cuatrimestre de la carrera de Bioquímica en el Departamento de Bioquímica Clínica (DBC) ubicado en el Laboratorio Central del Hospital de Clínicas “José de San Martín” de la Universidad de Buenos Aires. Tiene como propósito formar Bioquímicos con capacidad para la identificación de los agentes infecciosos (bacterias, virus, hongos y parásitos) y relacionarlos con las patologías que provocan, el tratamiento adecuado, su prevención y profilaxis dentro de un contexto clínico y epidemiológico.

La mayor fortaleza de esta asignatura es su inserción en el Laboratorio bioquímico del Hospital de Clínicas “José de San Martín” de la Universidad de Buenos Aires, donde se brindan servicios tanto a pacientes internados como ambulatorios. Los estudiantes transitan nuestros laboratorios, interactúan con otros profesionales, analizan materiales clínicos y adquieren conocimientos del desempeño profesional y de su rol en el equipo de salud.  Así mismo, acceden a equipamientos de última generación disponiblesen el ámbito hospitalarioque permiten un diagnóstico microbiológico rápido. La Práctica Profesional Interna se desarrolla enlos Trabajos Prácticos de la asignatura e incluyenel estudio microbiológico de especímenes clínicos con el abordajede sus etapas pre-analíticas, analíticas y pos-analíticas. Cada muestra corresponde a un caso clínico real donde se discuten y analizan los resultados obtenidos para finalmente validar esos resultados en el contexto del cuadro clínico del paciente.

La cátedra de Microbiología Clínica está constituida por cuatro áreas:

-Bacteriología Clínica

– Inmunología y Virología Clínica

– Micología Clínica

– Parasitología Clínica

Los docentes de cada una de estas áreas desempeñan actividades asistenciales y de investigación, las cuales se encuentran estrechamente ligadas y fortalecen la docencia de grado y posgrado.

1-Investigación: losdocentes de la cátedra forman parte del Instituto de Fisiopatología y Bioquímica Clínica (INFIBIOC) de la Universidad de Buenos Aires. Las líneas de investigación se enfocan a la Salud humana, en especial a la identificación de nuevos patógenos, resistencia a los antimicrobianos, diagnóstico, prevención e impacto clínico de las enfermedades infecciosas.

2-Transferencia tecnológica: se llevan a cabo distintos estudios microbiológicos o asesorías de alta complejidad para instituciones públicas o privadas que así lo requieran.

3-Servicios Asistenciales: Los Laboratorios de Bacteriología Clínica, de Inmunología y Virología Clínica, Micología y Parasitología Clínica, realizan los estudios microbiológicos a todos los pacientes que se atienden en el Hospital y a la comunidad que así lo requiera.

Profesora Titular

Dra. Famiglietti, Angela

ÁREA: BACTERIOLOGÍA CLÍNICA

Profesor Asociado

Dr. Vay, Carlos

Profesora Adjunta

Dra. Almuzara, Marisa

Jefes de Trabajos Prácticos

Dra. Barberis, Claudia

Dr. Rodríguez, Carlos Hernán

Bioq. Álvarez, Carla

Ad- Honorem

Dra. García, Susana

Ayudantes de Primera

Dra. Nastro, Marcela

Bioq. Esp. Losada, Mirta

Bioq. Barragán, Valentina

Bioq. Mancino, María Belén

Bioq. Cioffi, Antonela Mónica

Ad- Honorem

Mag. Canteros, Lorena

Bioq. Esp. Guzmán, Glenda

Bioq. Ferrari, Cynthia Karina

Bioq. Gauder, Catalina

Bioq. Potente, Eduardo Nicolás

ÁREA INMUNOLOGÍA Y VIROLOGÍA CLÍNICA

Profesor Asociado

Dr. Marcelo Rodríguez Fermepin

Jefes de Trabajos Prácticos

Dra. Entrocassi, Carolina

Dra. Gallo Vaulet, Lucia

Bioq. Esp. Mestre, Mariana

Bioq. Sosa, David

Bioq. Toledano, Analía

Ayudantes de Primera

Bioq. Alcaraz, Laura Daiana

Bioq. Büttner, Karina

Bioq. Ramos Cecilia

Ad- Honorem

Bioq. Cal, Valeria

Bioq. Senín, Vanesa Solange

Bioq. Urioste, Alejandra

Bioq. Vallejo, Micaela Soledad

Bioq. Varela, Carolina Lucia María

 Ayudante de Segunda

Ad- Honorem

Gargiullo, Laura

Pallero, Micaela Belén Beatriz

ÁREA MICOLOGÍA CLÍNICA

Profesora Adjunta

Mag. Fernández Norma

 Ayudante de Primera

Bioq. Farias Luciana

ÁREA PARASITOLOGÍA CLÍNICA

Profesora Adjunta

Bioq. Esp. Gatta, Claudia

Jefe de Trabajos Prácticos

Bioq. Esp. Arias, Liliana

Ayudantes de Primera

Bioq. Cervino, Iván

Bioq. Gentiluomo, Jimena Paola

ÁREA PRÁCTICA SOCIAL EDUCATIVA

Profesora Adjunta

Dra. Carolina Entrocassi

Normas de bioseguridad y seguridad operativa en el laboratorio de Microbiología Clínica. Sistemas de calidad y aseguramiento de la calidad.  Jerarquización de las muestras/especímenes clínicos. Diagnóstico microbiológico, inmunológico, molecular y epidemiología de las enfermedades infecciosas prevalentes en nuestro país y/o de impacto en salud producidas por bacterias, hongos, virus y parásitos.  Pronóstico y seguimiento terapéutico de las enfermedades infecciosas. Infecciones del sistema nervioso central, respiratorias, gastrointestinales y órganos anexos, infecciones del tracto urinario, genitales, de transmisión sexual, sepsis, endocarditis y otros síndromes febriles. Sensibilidad de los microorganismos a los antimicrobianos: criterios de ensayo, interpretación e informe de resultados. Impacto clínico de la resistencia. Uso adecuado de los antimicrobianos. Prevención de las enfermedades infecciosas, profilaxis y vacunas. Control y vigilancia epidemiológica de las infecciones asociadas a la atención de la salud

Área Bacteriología Clínica

Introducción a la bacteriología clínica. Métodos de Laboratorio. Muestreo. Conservación de las muestras. Procesamiento de especímenes clínicos. Identificación de Bacterias Gram negativas aerobias y anaerobias de importancia clínica: Enterobacterales. Vibrio y Aeromonas. Pseudomonas aeruginosa, Acinetobactrer y Stenotrophomonas maltophilia. Neisseria, Moraxella y Kingella. Bacteroides, Prevotella y Fusobacterium. Bacterias Gram positivas aerobias y anaerobias de importancia clínica: Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Listeria, Corynebacterium, Clostridium. Métodos fenotípicos y genotípicos de detección de  resistencia a los antimicrobianos y su aplicación en las infecciones humanas. Uso adecuado de los antibacterianos. Infecciones urinarias. Infecciones gastrointestinales. Infecciones respiratorias altas y bajas. Tuberculosis y Epidemiología. Micobacteriosis. Infecciones genitales e infecciones de transmisión sexual (ITS). Infecciones del Sistema Nervioso Central. Sepsis, bacteriemia y endocarditis.

Área Inmunología y Virología Clínica

Introducción a la inmunología y virología clínica. Principios de Epidemiología. Diagnóstico inmunológico de infecciones. Diagnóstico de las infecciones virales. Métodos de laboratorio. Infecciones virales: Hepatitis virales: A, B, C, D y E. Virus de la inmunodeficiencia humana (VIH). Virus de Epstein-Barr (EBV). Citomegalovirus (CMV). Rubeola. Herpes Simplex Virus tipo I y II. Virus del papiloma humano (HPV). Infecciones respiratorias virales: Influenza y otros virus respiratorios. Infecciones parasitarias: Toxoplasma gondii. Trypanosoma cruzi. Hidatidosis. Leishmaniasis. Infecciones Bacterianas: Infecciones transmisibles sexualmente (Sìfilis y Chlamydia trachomatis). Neumonías atípicas: Chlamydia psittaci, Chlamydia pneumoniae y Mycoplasma pneumoniae. Brucelosis. Enfermedades post-estreptocócicas. Infecciones emergentes y reemergentes. Dengue y SARS-CoV-2.

Área Micología Clínica

Introducción a la micología clínica. Célula fúngica. Hongos levaduriformes y filamentosos. Identificación de las especies más frecuentes de los géneros: Candida, Cryptococcus, Aspergillus, Fusarium y hongos del orden Mucorales (grupo demateaceos). Diagnóstico convencional e inmunológico de las micosis. Utilidad de la Reacción en Cadena de Polimerasa (PCR). Antifúngicos: tipos de antifúngicos, métodos de sensibilidad. Micosis superficiales. Dermatoficias, pitirosporosis, candidiasis cutáneomucosa. Micosis de implatación. Esporotricosis. Micetomas. Micosis profundas endémicas. Histoplasmosis, paracoccidioidomicosis, coccidioidomicosis. Micosis profundas oportunistas. Candidiasis, criptococcosis, aspergillosis, mucormicosis.

Área Parasitología Clínica

Introducción a la Parasitología clínica. Métodos de Laboratorio. Muestreo. Conservación de las muestras. Procesamiento de especímenes clínicos. Diagnóstico microscópico y macroscópico.  Helmintos: Cestodes, Trematodes y Nematodes. Protozoarios: Amebas, Flagelados, Ciliados y Coccidios. Hemoparásitos: Plasmodios, Tripanosomas y Leishmanias. Ectoparásitos: Artrópodos de importancia médica.

– Microbiología Biomédica. 2° edición. Editores: Basualdo J., Coto C., de Torres R (ed). Buenos Aires, Editorial Atlante 2006.

– Enfermedades infecciosas. Principios y Práctica. Mandell, GL. “7° y 8° ed. Editorial Médica Panamericana. 2011 y 2016.

– Manual of Clinical Microbiology. Versalovic J, Carroll K, Funke G, Jorgensen J,  Marie Louise Landry, Warmock D. ASM Press. Washington DC. 10th  y 11th edición. 2011 y 2015

BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA EN CADA ÁREA

1- Área Bacteriología Clínica

1.1 Libros:

– Murray Rosenthal, Pfaller. Microbiología Médica. Editorial Elsevier Saunders. 7º Edición 2013

– Koneman – Diagnóstico Microbiológico. Winn(h.)-Allen-Janfa-Koneman-Procop-Schrenckenberger-Woods. Editorial Médica Panamericana. 6ª edición. 2008.

– Bailey & Scott. Diagnóstico Microbiológico. Forbes, Betty, .Sahm, Daniel F.,  Weissfeld, Alice. Editorial Medica Panamericana. 11ª edición. 2004

-Biochemical Test for Identification of Medical Bacteria. Jean F. Mac Faddin. Lippircott-Willians and Wilkins. 3a edición. 2000.

– Antimicrobianos (Módulo 4). 2a edición. Editorial Publicaciones Latinoamericanas. Asociación Argentina de Microbiología y Colegio de Bioquímicos de la Provincia de Entre Ríos, Buenos Aires, Argentina. 2008

– Lopardo, H.; Predari, S. C.; Vay, C. “Manual de Microbiología Clínica de la Asociación Argentina de Microbiología”; Volumen I. Disponible en: https://aam.org.ar/manual%20bacteriologia%20clinica.pdf . 

– Libro Azul de Infectología Pediátrica. Ediciones FUNDASAP (Fundación Sociedad Argentina de Pediatría. 4º edición. FUNDASAP-SAP 2012

1.2 Lecturas recomendadas:

– Consenso de Endocarditis Infecciosa. Revista Argentina de Cardiología. Publicación Científica de la Sociedad Argentina de Cardiología. Volumen 70-Suplemento 5. 2002.

-Recomendaciones de diagnóstico y tratamiento de las infecciones de transmisión sexual. Comisión HIV/SIDAy de ITS de la SADI. Sociedad Argentina de Infectología (SADI); 2020. https://www.sadi.org.ar/comisiones-de-trabajo/comision-de-sida-y-ets/item/1364-recomendaciones-de-diagnostico-y-tratamiento-de-las-infecciones-de-transmision-sexual

– Consenso sobre la prueba de sensibilidad a los antimicrobianos en cocos gram -positivos. Famiglietti A., Quinteros M., Predari S. C., Corso A., Lopardo H., Bantar C., Couto E., Galas M., Goldberg M., Gutkind G., Pasteran F., Radice M., Soloaga R. Revista Argentina de Microbiología. 2003. 35: 29-40.

– Consenso sobre las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos en Enterobacteriaceae. A. Famiglietti, M. Quinteros, M. Vázquez, M. Marín, F. Nicola, M.Radice, M. Galas, F.Pasterán, C.Bantar, J. M. Casellas, J.KovenskyPupko, E. Couto, M. Goldberg, H.Lopardo, G.Gutkind, R.Soloaga. Revista Argentina de Microbiología. 2005. 37: 57-66.

– Criterio de ensayo interpretación e informe de las pruebas de sensibilidad a los antibióticos en los bacilos gran negativos no fermentadores de importancia clínica: recomendaciones de la subcomisión de antimicrobianos de la Sociedad Argentina de Bacteriología, Micología y Parasitología, Asociación Argentina de Microbiología. Radice M, Marin M, Giovanakis M, Vay C, Almuzara M, Limansky A, Casellas JM, Famiglietti A, Quinteros M, Bantar C, Galas M, Kovensky Pupko J, Nicola F, Pasteran F, Soloaga F. Gutkind G. Revista Argentina de Microbiología 2011; 43: 136-153.

1.3 Material disponible en el campus virtual del área y en material impreso:

– Clases Teóricas (Grabadas y PDF)

– Seminarios (Grabados y PDF)

–  Guía de Procedimientos en Bacteriología Clínica (2019)

– Guía de Trabajos Prácticos (2019)

– Videos de TP

– Videos de recolección de muestras clínicas

– Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility testing.  32nd Edition. CLSI M100. Wayne. PA Clinical and Laboratory Standards Institute. 2022

2- Inmunología y Virología Clínica

2.1. Libros:

-Virología Médica. Guadalupe Carballal, José Raúl Oubiña. Ed. Corpus. 4ªEd. 2014.

– Clinical Virology Manual, 4th edition, by Steven Specter, Richard L. Hodinka, Steven A. Young, and Danny L. Wiedbrauk, ASM Press. Washington DC. 4th ed. 2009

2.2 Lecturas Recomendadas:

Guía de Prevención y Tratamiento de las Infecciones Congénitas y Perinatales. Disponible: https://bancos.salud.gob.ar/recurso/guia-de-prevencion-y-tratamiento-de-infecciones-congenitas-y-perinatales

Guías para la atención al paciente infectado con Trypanosoma cruzi (Enfermedad de Chagas). Disponible: https://bancos.salud.gob.ar/recurso/guias-para-la-atencion-al-paciente-infectado-con-trypanosoma-cruzi-enfermedad-de-chagas

Consenso Argentino de Toxoplasmosis Congénita 2020. Medicina (Buenos Aires) 2021; 81: 257-268

Diagnóstico y tratamiento de sífilis. Recomendaciones para los equipos de salud. Actualización 2019. Disponible en: https://bancos.salud.gob.ar/sites/default/files/2019-11/2019-08-30_guia-sifilis.pdf 

Guía de infecciones respiratorias agudas (2019). Disponible en: https://campus.ffyb.uba.ar/pluginfile.php/475932/mod_label/intro/Gu%C3%ADa%20de%20infecciones%20respiratorias%20agudas%20%282019%29.pdf

Hepatitis virales, guía para el diagnóstico y tratamiento de la infección por el virus de la hepatitis B y C. Ministerio de Salud de la Nación Argentina 2021. Disponible en: https://bancos.salud.gob.ar/sites/default/files/2021-09/hepatitis-virales-diagnostico-tratamiento-de-infeccion-por-el-virus-de-hepatitis-B-y-C.pdf

2.3 Material disponibles en el campus virtual del área y en material impreso:

– Clases teóricas grabadas.

– PDF de seminarios

– Guía de Trabajos Prácticos

3- Área Micología Clínica

3.1. Libros:

– Arenas Guzmán Roberto. Micología medica ilustrada. Mc.Graw. Hill 5ª Edición. 2014

– Larone Davise. Medically important fungi. A guide to identification. ASM Press. Washington DC. 5th edition.

– Bonifaz Alejandro. Micología médica básica. Mc.Graw. Hill 4ta edición .2012

3.2. Lecturas Recomendadas:

– Epidemiología, especies, resistencia antifúngica y evolución de las candidemias en un hospital universitario de Buenos Aires, Argentina, durante 16 años. Rev Chilena Infectol 2017; 34 (5): 431-440

– Mucormicosis. Una micosis emergente. Medicina (Buenos Aires) 2012; 72: 23-27

– Guía para el diagnóstico de laboratorio de enfermedad fúngica invasora por hongos filamentosos. Cruz R. Rev Chilena Infectol 2014; 31 (2): 173-179

– Aislamiento de Candida dubliniensis en distintos materiales clínicos. Análisis de métodos fenotípicos de diferenciación con Candida albicans. Revista Argentina de Microbiología,2008; 40,211-217

– Los métodos de laboratorio en el diagnóstico de la coccidioidomicosis. Rev Chilena Infectol 2014; 31 (3): 293-297

– Criptococosis. Rev. Méd. Risaralda 2013; 19 (2):147-153.

– Las infecciones fúngicas en la pandemia de COVID-19, el caso de la mucormicosis. Revista Argentina de Microbiología 2021; 53,181-182. https://doi.org/10.1016/j.ram.2021.09.001

– Un patógeno fúngico emergente multirresistente en Argentina. Revista Argentina de Microbiología 2022; 54,261-262. https://doi.org/10.1016/j.ram.2022.11.001

3.3 Material disponible en el campus virtual del área y en material impreso:

– Seminarios grabados.

– Guía Teórica.

– Guía de Trabajos Prácticos.

– Glosario.

– Material Anexo

4- Área Parasitología Clínica

4.1. Libros:

– Parasitología médica. Atías, A. Ed. Mediterráneo, 4ª edición (1998). (Se encuentra en la biblioteca de FFYB).

– Markell and Voge`s Medical Parasitology. Markell, E.K, John, D.T, Krotoski, W.A. W.B. Saunders Company, eighth edition (1999). (La 6° edición en castellano se encuentra en la biblioteca de FFYB).

– Parasitosis humanas Botero D, Restrepo M. Editorial CIB, Medellín Colombia, 5 edición 2012

– Parasitología Humana. Werner Apt. Editorial Mc Graw Hill, México, 1 edición, 2013

– Parasitología Médica Becerril Marco Antonio. Editorial Mc Graw Hill, México, 5 edición. 2019

4.2 Atlas

– Lecciones Prácticas sobre Enteroparasitosis Humanas. Dr. O. C. Méndez. Ed. Federación Bioquímica de la Pcia de Buenos Aires. (1998). (Se encuentra en la biblioteca de FFYB).

– Atlas de Parasitología. López Páez MC, Corredor Arjona A, Nicholls Orejuela RS, Duque Beltrán S, Moncada Álvarez LI, Reyes Harker P, Rodríguez Toro G. Editorial El Manual Moderno, Universidad Nacional de Colombia, 2 edición, 2012 (Se encuentra en la biblioteca de FFYB)

4.3 Lecturas Recomendadas:

– Nuevas Guías de toma de muestras para análisis parasitológico. Agosto 2020. Página Web de la Asociación Argentina de Microbiología (AAM) https://www.aam.org.ar/publicaciones/otras/actualizaciones-y-guias

– Decálogo para la toma de decisiones sobre la prevención, el control y la atención de la enfermedad de chagas OPS 2022

– Prevención, diagnóstico y tratamiento de la transmisión vertical del T. cruzi Algoritmo Chagas 1er nivel de atención 2022, Ministerio de Salud Argentina.

4.4 Material disponible en el campus virtual del área y en material impreso:

-Teóricos grabados y PDF

– Guía de Trabajos Prácticos

-Trabajos Prácticos grabados

– Casos Clínicos

– Ejercicios de Autoevaluación

– Videos ilustrativos sobre algunas parasitosis

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